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重大突破:我校油茶創(chuàng)新團隊聯(lián)合多單位破譯8.8G六倍體油茶復(fù)雜基因組


本網(wǎng)訊 近日,,我校朱華國教授團隊聯(lián)合華中農(nóng)業(yè)大學(xué)金雙俠教授團隊等在國際知名學(xué)術(shù)期刊Plant Biotechnology Journal上(影響因子10.1)發(fā)表了“The complex hexaploid oil-Camellia genome traces back its phylogenomic history and multi-omics analysis of Camellia oil biosynthesis”的研究論文,破譯8.8G六倍體油茶復(fù)雜基因組,,為油茶遺傳改良及揭示茶屬植物多倍體進化提供重要理論依據(jù),。論文首次完成了六倍體普通油茶染色體尺度的基因組測序及組裝,獲得了湖北省主栽油茶品種長林40號8.80 Gb的基因組序列,,包含135,868個基因,,平均長度為3,936 bp,其中scaffold N50為180.0 Mb,。比較和進化分析表明,,大約906萬年前發(fā)生了三輪全基因組重復(fù)(WGD)事件,導(dǎo)致了六倍體普通油茶長林40號與二倍體狹葉油茶及南榮油茶的分離,。

 

普通油茶長林40號基因組組裝示意圖


此外,,通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)方法的聯(lián)合分析,,構(gòu)建了一個油茶脂肪酸合成代謝的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),,鑒定潛在的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因(SAD、FAD2和FAD3)和轉(zhuǎn)錄因子(AP2和C2H2)參與了油茶脂肪酸的合成代謝,,特別是不飽和脂肪酸的生物合成,。上述研究所產(chǎn)生的基因組資源對于加快六倍體普通油茶分子生物學(xué)和遺傳改良研究,以及揭示茶屬植物多倍體基因組進化具有巨大潛力,。

 

普通油茶長林40號油脂代謝調(diào)控模式


黃岡師范學(xué)院朱華國教授,、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)許忠平博士、王福秋博士等為該論文的共同第一作者,,黃岡師范學(xué)院胡孝明教授,、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)金雙俠教授等為共同通訊作者。華中農(nóng)業(yè)大學(xué)葛賢宏教授和陳偉教授,,中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院胡麗松研究員,、湖北省林業(yè)科學(xué)研究院程軍勇研究員等參與了該研究工作。該研究得到了國家自然科學(xué)基金和國家杰出青年科學(xué)基金等項目資助,。


審核人:閔艷林

(文,、圖:朱華國 實習(xí)編輯:劉文軒 責(zé)編:黃師宣)


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作者:生物與農(nóng)業(yè)資源學(xué)院發(fā)布時間:2024-06-25

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